其次，對于胎兒來講，雙胎的早產率、流產率、低體重兒及出生缺陷發生率遠遠高于單胎，其圍產兒死亡率也比單胎妊娠高5倍。早產的孩子出生體重低，雙胎的低體重兒概率比單胎高8倍，其各個器官和系統發育都差于單胎孩子，新生兒的罹病率和死亡率顯著增加，即使順利出生，總有些或多或少的問題存在，有的體質羸弱，有的發育遲緩，有的聽覺或視覺有問題，有的甚至罹患先天性疾病。

試管嬰兒的最終目的是為了能夠讓不孕夫婦抱得一個健康、足月的寶寶回家，單胎、足月、活產、安全才是最重要的。對于一些身材矮小、疤痕子宮及有過不良孕產史的不孕患者來說，單胚胎移植的意義更大。